Oi Luiz
O ideal é fazer o upgrade via SP/EHP mas sabemos que isso muitas vezes não é tão simples. Como já comentei no blog Política pra atualização do support package do SAP NF-e (GRC)
é importante que a empresa mantenha o ambiente o mais atualizado possível visto que o governo constantemente altera a legislação.
Pelo que vc deixou entender... terá que aplicar as notas manualmente e neste caso a atenção deve ser grande já que existem muito passos manuais e um erro na aplicação de uma nota pode gerar um grande atraso até identificar o que foi feito de errado.
Boa sorte
Eduardo Chagas